大腸の悪性上皮性腫腸のほとんどが大腸がんでありわが国では近年増加傾向を示しており，2019年時点で悪性腫揚の中で罹患率が男女とも2位で男女合わせると1位となっている。増加の原因として食事の欧米化，生活習慣が関係していると考えられており，リスク因子としては赤肉加工肉の摂取， 喫煙，飲洒，肥満，運動不足，食物線維の不足等が指摘されている。 大腸がんの初期では自覚症状がなく，検診で便潜血や貧血を指摘されて発見されることが多い。進行すると右側大腸がんでは下血（赤黒い出血），腫廂触知，左側大腸がんでは便通異常（下痢，便秘），腹痛血便（赤い出血），便柱狭小（便が細くなる）等の症状が現れる．診断は大腸内視鏡による観察と生検によって確定するが進行がんでは肝臓、肺、リンパ節等に転移することがあるのでCT検査やMRI検査PET検査等で転移検索をすることが必須である．これらの検査を総合して進行度（ステージ分類）が決められる．治療はこの進行度によって決められるがステージIからIIIまでは手術ステージIV（肝臓や肺等に遠隔転移がある症例）は手術やがん化学療法，放射線治療を組み合わせて行うことが推奨されている。

大腸がん手術は現在は腹腔鏡による傷の小さい低侵襲手術が主流となっており,直腸がんでは最近ロボット支援手術も行われるようになった。

良性上皮性腫瘍の代表は腺抽（ポリープ）である．大腸の腺腫性ポリープはがん化のリスクがあるため，内視鏡的に切除することが望ましいとされているポリープが多発する病態（多くは100個以上）はポリポーシスと呼ばれている。